Monseñor Mario de Jesús Álvarez Gómez nació en Palmitas, municipio de Medellín, en territorio de la diócesis de Santa Rosa de Osos, el 19 de octubre de 1959.

Cursó sus estudios primarios en Palmitas, su pueblo natal, y en el Seminario Menor Diocesano de Santa Rosa de Osos obtuvo el bachillerato académico. Inmediatamente después, pasó al Seminario Mayor de Santa Rosa de Osos y allí cursó la filosofía y la teología.

Fue ordenado sacerdote el 19 de noviembre de 1985 e incardinado en la diócesis de Santa Rosa de Osos. Posteriormente en 1993, obtuvo la licenciatura en teología bíblica en la Universidad Gregoriana en Roma.

En el curso de su ministerio presbiteral ha recibido los siguientes cargos:

Vicario parroquial de Entrerríos (1985-1987);
Profesor en el Seminario Menor Diocesano (1987-1989);
Prefecto de Disciplina en el Seminario Menor (1988);
Administrador parroquial en El Brasil (1989-1990);
Profesor de Filosofía y Lenguas en el Seminario Mayor (1990);
Estudios de teología bíblica en Roma (1990-1993);
Profesor en el Seminario Mayor Diocesano (1994-1995);
Vicario general de la diócesis de Santa Rosa de Osos (1995-2000);
Vicario de Pastoral en la misma diócesis (1997-2000);
Rector del Seminario Mayor Diocesano (1999-2003);
Párroco en San Pedro de los Milagros (2003-2008);
Párroco en la Catedral de Santa Rosa de Osos (2009-2010);
Director de las Obras Misionales Pontificias de Colombia (2010 - 2018).

El 3 de febrero de 2018 Su Santidad, el Papa Francisco, lo nombró obispo de Istmina-Tadó. El 3 de marzo del mismo año fue su ordenación episcopal.

El 29 de junio de 2022 Su Santidad, el Papa Francisco, lo nombró como administrador apostólico de la Diócesis de Quibdó.