La diócesis de Garagoa (en latín: Dioecesis Garagoënsis) es una circunscripción eclesiástica de la Iglesia católica en Colombia, con sede en el municipio del mismo nombre, y hace parte de la provincia eclesiástica de Tunja.

Fue erigida el 26 de abril de 1977 con la bula Cum Venerabilis del papa Pablo VI, con territorio desmembrado de la arquidiócesis de Tunja.

Está conformada por las parroquias existentes en los municipios de Garagoa, Jenesano, Ramiriquí, Rondón, Tibaná, Úmbita, Chinavita, Berbeo, Guateque, Sutatenza, Somondoco, Guayatá, Almeida, Chivor, Macanal, Campohermoso, Páez, Santa María, San Luis de Gaceno, San Eduardo y Miraflores.

Su territorio limita al norte con la arquidiócesis de Tunja, al este con la diócesis de Yopal, al sur con la arquidiócesis de Villavicencio, al suroeste con la arquidiócesis de Bogotá y al oeste con la diócesis de Zipaquirá.

Su primer obispo fue Monseñor Juan Eliseo Mojica Oliveros, nacido en Susacón, (Boyacá), el 12 de junio de 1918. Ordenado sacerdote el 7 de junio de 1941 y consagrado obispo el 1 de mayo de 1967 como auxiliar de Tunja y titular de Baliana. Fue nombrado obispo de Jericó (Antioquia), el 4 de junio de 1970 y el 26 de abril de 1977 pasó a ser el primer obispo de la recién creada Diócesis de Garagoa, tomando posesión el 17 de junio del mismo año. Murió el 29 de diciembre de 1989.

Monseñor Guillermo Álvaro Ortiz Carrillo fue nombrado como segundo obispo de la diócesis. Natural de Fosca (Cundinamarca), recibió la ordenación sacerdotal el 6 de diciembre de 1953. El 3 de mayo de 1986 fue nombrado obispo auxiliar de Bogotá y recibió la consagración episcopal el 13 de junio del mismo año. El 16 de febrero de 1989 fue nombrado Administrador Apostólico de Garagoa (Obispo Coadjutor) y a partir de diciembre del mismo año obispo titular. Murió el 24 de febrero del año 2000, año del Jubileo de la Redención. 

El 23 de junio de 2000 su Santidad Juan Pablo II nombró a Monseñor José Vicente Huertas Vargas como el tercer obispo de Garagoa. Natural de Ramiriquí (Boyacá), 12 de abril de 1940, fue ordenado sacerdote el 11 de febrero de 1967 incardinándose en la diócesis de Tunja. Su consagración episcopal fue el 4 de agosto de 2000. El 15 de junio de 2017 el Papa Francisco aceptó su renuncia al gobierno pastoral de la diócesis. Falleció el 10 de agosto de 2023. 

El 15 de junio de 2017 Su Santidad el Papa Francisco nombró a Monseñor Julio Hernando Peláez García como el cuarto obispo de la Diócesis. Tomó posesión de la sede asignada el 8 de julio del mismo año. Monseñor Julio Hernando previamente había sido obispo de Istmina-Tadó (2010-2017) y obispo auxiliar de la Arquidiócesis de Cali (2005-2010). Perteneciente al celro de la Diócesis de Pereira, Monseñor Julio Hernando es oriundo de Anserma (Caldas) y había recibido su ordenación sacerdotal el 2 de junio de 1985 y su consagración episcopal el 2 de abril de 2005.