Desde el año 1893 la “Custodia Capuchina” extendió su acción pastoral a los indígenas del Putumayo, Caquetá y Amazonas, por invitación de Monseñor Manuel Caicedo, Obispo de Pasto.

En 1904 se confió la evangelización de este territorio a los Frailes Menores Capuchinos. Asumió la responsabilidad evangelizadora la Provincia Capuchina de Cataluña y Baleares que atendió la Prefectura de Caquetá, Putumayo y las Amazonas.