Desde 1914 era atendido desde el Vicariato Apostólico de los Llanos de San Martín por los Padres Monfortianos. El Papa Pío XII, creó la prefectura Apostólica de Mitú el 9 de junio de 1949, encomendado desde entonces al Instituto de Misiones Extranjeras de Yarumal (IMEY). Disgregándola del amplísimo territorio del Vicariato Apostólico de los Llanos de San Martín.